Животный мир
На территории Башкортостана выявлено 120 видов одноклеточных, около 700 видов червей, 121 — моллюсков, около 5000 — членистоногих, 47 — рыб, 10 — земноводных, 10 — пресмыкающихся, 296-птиц, 76- млекопитающих. Многие виды животных имеют обширный ареал. Некоторые виды ограничены только Уральскими горами.
Так, по территории РБ проходит восточная граница распространения ряда видов рыб: ручьевой форели, европейского хариуса, судака, берша, сазана, голавля, подуста, жереха, чехони, быстрянки, леща, белоглазки, густеры, синца, обыкновенного сома и др.
Уральскими горами ограничено распространение прудовой и травяной лягушек, краснобрюхой жерлянки и гребенчатого тритона. Лишь в южной части Башкортостана изредка встречаются болотная черепаха и степная гадюка. В Башкирском Зауралье зарегистрированы огарь, черный турпан, белая куропатка, шилоклювка, кречетка, белокрылый жаворонок, каменка-плясунья, малая мухоловка, а в Башкирском Предуралье — пеночка-трещотка, крапивник; другие птицы имеют широкий ареал. Из млекопитающих только в южных районах встречаются пищуха малая, хомяки серый и эверсмана, а рыжеватый или большой суслик населяет районы, расположенные на левобережье реки Агидель.
В республике обитает несколько видов позвоночных, завезенных с целью обогащения фауны (из рыб — пелядъ, белый амур и толстолобик; из млекопитающих — выхухоль, ондатра; реакклиматизированый марал, бобр, сурок степной, которые были уничтожены ранее). Имеются и случайные поселенцы (игла-рыба в озере Асылыкуль и ротан-головешка в ряде водоемов республики). Большинство видов животных распространено по всей территории Башкортостана. Отдельные виды приурочены к определённым эколого-географическим условиям. Открытые пространства населяют сурок, тушканчик, заяц-русак, степной хорёк, серая куропатка, полевой жаворонок. В лесах можно встретить медведя, рысь, куницу, бурундука, белку, рябчика; водоемы населены такими видами как бобер, выдра, ондатра, утки, чайки, поганки, болотная черепаха и др.
Некоторые виды рыб обитают только в реках (хариус, подуст, стерлядь и др.) и стоячих водоемах (карась, линь и др.). По характеру пищевых связей животные подразделяются на несколько групп. Большое количество их относится к растительноядным (траво-, листо-, зерно-, плодоядные, короеды и др.), из млекопитающих — копытные и грызуны, из птиц — гуси и куриные, из рыб — краснопёрка, белый амур и толстолобик, из беспозвоночных — в основном насекомые. Наиболее разнообразную группу животных представляют хищники, которые распространены широко, от инфузорий до зверей.
Основу промысла и любительского улова в республике составляют: окунь, щука, плотва, лещ, густера, карась, голавль, язь, реже чехонь, уклейка, елец, судак, жерех. В прудах выращивают карпов, нередко совместно с толстолобиком и белым амуром.
Объектами спортивной охоты являются утиные: чирок-свистунок, чирок-трескунок, кряква, красноголовый нырок, хохлатая чернеть, реже — серая утка, свиязь, широконоска и др. В определенное время открывается охота на рябчиков, тетеревов, глухарей и на вальдшнепа. К числу охотничьих зверей, добываемых в республике, относятся представители семьи куньих (куница, американская норка, колонок, горностай, ласка, светлый хорек, барсук), собачьих (волк, лисица, енотовидная собака), зайцев — беляк и русак. Добыча лося, косули, кабана, медведя, бобра осуществляется строго но нормам
Растительный мир
Растительность Башкортостана разнообразна. Это обусловлено тем, что территория Башкортостана расположена на стыке степной и лесной зон. На равнинных участках выражена зональность (степная, лесостепная и лесная зоны). Широтная зональность растительности республики усложнена явлениями вертикальной поясности, которые вызваны наличием на ее территории крупной горной системы — Уральских гор. Кроме того, положение РБ на стыке Европы и Азии объединило на ограниченной территории чисто европейские типы, такие как липово-дубовые леса и сибирские варианты, подобные лиственничным лесам с разнотравьем.
Леса Башкортостана представлены преимущественно широколиственными деревьями с преобладанием дуба, липы, ильма, осины. В травяном покрове основным растением является сныть, к которой в более северных районах могут примешиваться чина весенняя, ясменник пахучий, копытень европейский, звездчатка злаковая, а в более южных — чина гороховидная, вишня кустарниковая, вейник наземный, миндаль-бобовник и другие. Для подлеска широколиственных лесов характерны орешник, бересклет, рябина.
Хвойные леса встречаются в северной части Башкирского Предуралья, где древостой формируются из пихты и ели. Основные массивы хвойных лесов связаны с горными районами. В нижней части горные леса формируются сосной, в верхней — елью, под пологом которой развивается пышный зеленый покров, состоящий из брусники, черники и других таежных растений. В центральных районах Башкирского (Южного) Урала (хребет Крака, Зилаирское плато) и в восточных предгорьях (Крыктытау, Ирендык) небольшими участками сохранились лиственничные леса. Значительная часть сосновых лесов уничтожена рубками и заместилась мелколиственными лесами. Пойменные леса образуют тополя, ивы, липы. По заболоченным участкам поймы, вдоль коренного берега, чаще встречается чёрная ольха. Тополёвые и ивовые леса нарушены человеком полностью или частично.
До начала интенсивного освоения территории Башкортостана степи занимали не менее трети её равнинной части. После освоения площадь степей резко сократилась, а в Предуралье они почти исчезли. Освоение целины в начале 50-х годов ликвидировало равнинные степи Башкирского Зауралья. Основные массивы степей сохранились на склонах гор и холмов в Зауралье, а также в предгорных районах Предуралья на Бугульминско-Белебеевской возвышенности и северных отрогах Общего Сырта. Во всех трёх зональных вариантах степей на маломощных скелетных почвах вершин гор и их южных склонов произрастают растения-камнелюбы (тимьяны, горноколосник, гвоздика иглолистная и другие). В равнинной части РВ (в основном в южной части Зауралья) небольшими участками сохранились солонцеватые степи.
Луга в РБ имеют чаще вторичный характер и формируются на месте вырубленных лесов, при регулярном сенокошении или выпасе скота. Для горных лугов характерны высокотравные виды (горцы змеиный и альпийский, кровохлебка лекарственная и др.) при невысоком участии злаков (ежа сборная, овсяница луговая) и бобовых. В травостое этих лугов обильна манжетка. Суходольные луга на равнине расположены в северной части республики и представлены в основном травостоями с доминированием мятлика узколистного. Основное разнообразие лугов РБ — в речных поймах, где вдоль русла расположены высокоурожайные пырейно-костровые луга, а в центре поймы — злаковые.
Болота в РБ занимают незначительную площадь. В высокогорьях (на вершинах гор Иремель, Ямантау и др.) расположены специфичные горные тундры, где встречаются голубика, водяника, дриада и другие растения, характерные для этой зоны. Значительную площадь в РБ занимают полынь, лебеда, конопля, чертополохи, крапива, лопух, донники, череда и др. Они играют важную роль в формировании экологически благоприятного режима в городских и сельских поселениях, так как препятствуют эрозии почвы и поглощают токсичные вещества.