Созданные в 30-х гг. в Казахстане концентрационные лагеря, особенно такие крупные, как Карлаг и Степлаг, стали местом ссылки десятков тысяч врагов народа и других "вредных" и "социально чуждых" элементов, многие из которых в дальнейшем остались на постоянное местожительство в Казахстане. Все это кардинальным образом трансформировало этнодемографическую ситуацию в республике.
Огромный след в зтнодемографической истории Казахстана оставила Великая Отечественная война. Из 7,6 млн. человек населения, включая спецпереселенцев и эвакуированных, на защиту Отечества встали 1200 тыс. человек. Из них погибли в годы войны 410 тыс. и пропали без вести 125 тыс. человек. За годы войны в Казахстан было также эвакуировано свыше 1 млн. человек из района военных действий и прифронтовых регионов.
В ходе войны перманентно продолжалась депортация многих народов на территорию Казахстана. Началась она в предвоенный период. В 1941—1942 гг. в СССР было переселено 1 209 430 немцев. В Казахстане их насчитывалось 444 005 человек. В ноябре 1942 г. из Саратовской области в Казахстан было вывезено 2014 поляков.
В мае 1944 г. Государственный комитет обороны принял постановление выселить всех крымских татар с территории полуострова. Решение мотивировалось сотрудничеством части населения с фашистскими оккупантами. В большинстве своем крымские татары были переселены в Узбекскую ССР, часть попала в Казахстан. В декабре 1943 г. была ликвидирована Калмыцкая АССР. После ее упразднения 91 919 калмыков были переселены в другие регионы СССР. Из них в Казахстане оказались 2268 человек. В марте 1944 г. переселению подверглись балкарцы. В Казахской ССР их было размещено 18 219 человек. Немного ранее, в ноябре 1943 г., подобная участь постигла карачаевцев. Поводом к этому послужили измена Советской власти некоторых карачаевцев. Репрессии обрушились на весь народ. Было переселено 62 842 карачаевца. В Казахскую ССР попали 36 309 человек.
В 1944 г. была ликвидирована Чечено-Ингушская АССР. В феврале было выселено 310 630 чеченцев и 78 479 ингушей. В марте того же года в Казахстан прибыло 344 589 человек. В Джамбулской области было расселено 16 565 человек, в Алма-Атинской — 29 089, вВосточно-Казахстанской — 34 167, в Южно-Казахстанской — 39 542, в Актюбинской — 20 309, в Семипалатинской — 31 236, в Павлодарской — 41 230, в Карагандинской — 37 938 человек. К этим переселенцам прибавились тысячи чеченцев и ингушей, уволенных из рядов Красной Армии после февраля 1944 г. Всего в Казахстан их прибыло свыше 60 тыс. человек.
В мае 1942 г. из Краснодарского края Ростовской области, Крымской АССР, Армении, Азербайджана и Грузии в общей сложности было выселено 24 670 греков, многие из которых были расселены в Северном и Западном Казахстане. В августе 1944 г. было принято решение о выселении из Грузии в Казахстан и Киргизию турок, в Узбекистан — турок, курдов и хемшидов. Было выселено 45 516 турок, 8694 курда, 1385 хемшидов и 29 505 представителей других этнических групп.
Общую цифру спецпоселенцев в Казахстане назвать очень сложно, она почти ежегодно менялась. Так, на 1 января 1949 г. в республике насчитывалось 820 165 спецпоселенцев. На 1 июля 1952 г. на учете состояло уже 974 469 человек. Из них в Акмолинской области было размещено 117 183 человек, в Актюбинской — 31 618, в Алма-Атинской — 55 587, в Восточно-Казахстанской — 45 055, в Гурьевской — 8128, в Джамбулской — 68 581, в Западно-Казахстанской — 1335, в Карагандинской — 133 017, в Кзыл-Ординской — 25 225, в Кокчетав-ской — 98 128, в Кустанайской — 81 091, в Павлодарской — 66 680, в Северо-Казахстанской — 47 343, в Семипалатинской — 52 517, в Талды-Курганской — 38 115, в Южно-Казахстанской — 104 866 человек.
Менее чем через полгода, к 1 января 1953 г., в Казахстане находилось всего 988 373 спецпоселенца, что составило 35,9 % общего числа спецпоселенцев, находившихся на всей территории СССР, — 2 753 356 человек.
Этнический состав казахстанских спецпоселенцев был таким (чел.):
| Немцы | — | 448 626 | |
| С Северного Кавказа | — | 379 104 | |
| В том числе чеченцы | — | 244 674 | |
| Ингуши | — | 80 844 | |
| Карачаевцы | — | 35 735 | |
| Балкарцы | — | 16 819 | |
| Другие | — | 1032 | |
| С Черноморского побережья | — | 37 218 | |
| В том числе греки | — | 37 114 | |
| Турки | — | 18 | |
| Дашнаки | — | 16 | |
| Другие | — | 69 | |
| Поляки | — | 35 960 | |
| Переселенцы из Грузии в 1944 г. | — | 32 619 | |
| В том числе турки | — | 13 260 | |
| Курды | — | 5 530 | |
| Хемшиды | — | 422 | |
| Другие | — | 13 407 | |
| Переселенцы из Грузии в 1951—1952 гг. | — | 11 685 | |
| Из Крыма | — | 6 560 | |
| В том числе татары | — | 2 511 | |
| Болгары | — | 1 868 | |
| Греки | — | 1 240 | |
| Армяне | — | 575 | |
| Другие | — | 366 | |
| Из Краснодарского края | |||
| и Ростовской области в 1942 г. | — | 6 057 | |
| В том числе иранцы | — | 4 707 | |
| Кулаки из Белоруссии в 1952 г. | — | 4 431 | |
| Из Молдавии в 1940—1941 гг. | — | 3 681 | |
| Басмачи | — | 2 747 | |
| Калмыки | — | 2 472 | |
| Кабардинцы | — | 1717 | |
| "Власовцы" | — | 1 327 | |
| Из западных областей Украинской | |||
| и Белорусской ССР в 1940—1941 гг. | — | 657 | |
| С иранской и афганской границы | — | 634 | |
| Из Прибалтики в 1945—1949 гг. | — | 9 | |
| Из Молдавии в 1949 г. | — | 5 | |
Положение спецпоселенцев было очень тяжелым, им не хватало жилья, продовольствия, тысячи людей умирали от голода и болезней. По сведениям отдела спецпоселений НКВД, из всех переселенных чеченцев, ингушей, балкарцев и карачаевцев с 1944 по 1948 г. умерло 144 704 человек, или 23,7 % общего числа, в том числе в Казахской ССР - 101 036 человек.
Ситуация осложнялась еще и тем, что в Казахстан во время Великой Отечественной войны прибыли сотни тысяч эвакуированных. К концу 1941 г. их общая численность составила 386 492 человек, из них свыше 136,5 тыс. детей. В 1942 г. в республику из Воронежской, Сталинградской, Ростовской областей и Северного Кавказа прибыло 109 807 человек. В основном они были размещены в северных и северно-восточных областях Казахстана. К концу 1942 г. в Казахстане уже насчитывалось 532,5 тыс. эвакуированных. В целом же за годы войны республика приняла около 1,5 млн. человек, эвакуированных из временно оккупированных западных районов СССР.
Прибытие в республику такого количества людей восполняло нехватку трудовых ресурсов для народного хозяйства. Если численность рабочих и служащих в 1943 г. по сравнению с 1940 г. в целом по стране сократилась на 38 %, то в Казахстане, наоборот, она возросла на 7 %. В то же время на стройках и промышленных предприятиях Урала, Сибири и Центральной России работало свыше 200 тыс. человек из Казахстана.
В трудовые колонны в общей сложности было призвано более 700 тыс. трудящихся республики, главным образом переселенцев, которые работали на строительстве объектов оборонного значения Уралаи Сибири. После Великой Отечественной войны реэвакуация населения и отъезд рабочих в освобожденные районы привели к сокращению численности населения Казахстана. В 1945 г. в сравнении с 1943 г. численность населения сократилась на 5,3 %.
В целом же за годы Великой Отечественной войны значительно снизилась рождаемость населения, повысилась смертность, снизился естественный прирост населения. Сократилась численность сельских жителей, зато увеличилось число горожан — в первую очередь благодаря миграциям, большому числу эвакуированных и спецпереселенцев. В послевоенный период рождаемость и естественный прирост остаются очень низкими. Таким образом, миграции и переселения в годы войны в Казахстан сопровождались сильными откатными движениями, особенно после начала освобождения европейской части СССР от фашистской оккупации. Первыми начинаются возвратные маятниковые миграции эвакуированных из Казахстана. Позднее, после XX съезда КПСС и разрешения депортированным народам вернуться на историческую родину, многие из них, особенно народы Северного Кавказа, эмигрируют из Казахстана.
В послевоенный период продолжается преобладание механического движения населения над естественным. Из Казахстана выезжают последние волны эвакуированных в республику в годы войны. Одновременно нарастает встречная волна "ссыльных" иммигрантов, среди которых немало побывавших в "немецком" плену, "власовцев", "оуновцев", "врагов народа", спецпоселенцев и других жертв сталинских репрессий и военных действий, собственно немцев, немецких и японских военнопленных и др. Не пустели Карлаги и "Степлаги", а начавшаяся кампания по так называемому "делу врачей", как и многие другие "идеологические" и "изобличительные" процессы, постоянно пополняла ряды казахстанской интеллигенции. При этом по-прежнему продолжались оргнаборы рабочих кадров на фабрики и заводы республики.
Население Казахстана в 50-х гг. Десятилетие 1951—1960 гг. составляет особую страницу в истории формирования многонационального населения Казахстана. Февральско-мартовский пленум ЦК КПСС 1954 г. поставил задачу массового освоения целинных и залежных земель в кратчайшие сроки.
Целинные и залежные земли осваивались главным образом в Кустанайской, Целиноградской, Северо-Казахстанской, Павлодарской и Кокчетавской областях. В 1970 г. из ряда районов Акмолинской и Кустанайской областей была воссоздана Тургайская область. Посевные площади в республике возросли с 9,7 млн. га в 1953 г. до 34,2 млн. га в 1973 г., а посевы под зерновыми культурами — соответственно с 7,02 млн. до 24,7 млн. га.