Рано утром 31 июня католическое население стало собираться у костела около ратуши. Приходили старики и дети, мужчины и женщины, служащие и чиновники. Непосвященным в тайну задуманной демонстрации казалось, что народ собирается на торжество, повторяемое католической церковью со дня праздника Тела Господня. Когда в яркий солнечный день большое количество людей собралось на площади, стало ясно, что толпы народа направятся в Польшу. Недавно заступивший на пост вице-губернатор П. И. Корецкий приказал выставить на набережную казаков и 2 роты солдат и воздерживаться от насилия, ожидая дальнейших приказов. Сам Корецкий, надеясь остановить толпу без агрессивных стычек, отправился на место происшествия.
После окончания молебна народ неудержимой толпой двинулся к реке. Стоявший на другой стороне улицы возле храма св. Николая П. И. Корецкий, видя неконтролируемую ситуацию, приказал развести мост. Началась страшная давка, войска стояли смирно под ружье. События развивались столь стремительно, что не было возможности остановить демонстрантов. Толпа под пение революционных гимнов восстановила разведенный мост и отправилась в царство Польское.
Вооруженное восстание, вследствие бездеятельности чиновников, все же разгорелось, правда, вдали от Ковно 15 марта 1863г. В городе собирали деньги на восстание по 2,5 рубля с души. Гимназии были временно закрыты. Многие, вследствие волнений среди населения Ковно, бежали в леса. Женщины выходили на улицы только в траурных платьях, а те русские дамы, которые покидали свои дома без траура, подвергались злым насмешкам и жестоким оскорблениям.
Об ужасах братоубийственной войны ковенские жители были хорошо наслышаны. 16 апреля в местечке Вижуны Вилкомирского уезда был повешен пятисотский Филипп Лебедев, единственный сын 60-летней вдовы. Жизнь крестьянина, убитого по заказу, оценивалась всего в 2 рубля.
Предводители восстания, орудовавшие в Паневежском уезде, - Сераковский, бывший капитан генерального штаба русских войск по прозвищу Доленги, Колышко, Станишевский, Лобановский и ксендз Мацкевич были разбиты майором Мерлином и генералом И. С. Гонецким 26 и 27 апреля в стычках при Шнуркишках, Гудышках и Медейках. После усмирения мятежа некоторых из вожаков судили и казнили в Ковно. Ковенская губерния успокоилась только в ноябре 1863г.
Далее город жил своей обычной жизнью до 1-й мировой войны. В это время русские эвакуировались из Литвы на Восток и в период с 1914 по 1918 год в Ковно находились немецкие войска, устанавливая здесь свои законы. Кардинально всё изменилось, когда Литва отделилась от России. С этих пор Ковно стал называться Каунасом. В то время, когда Вильнюс отошёл к Польше, Каунас в 1929 году стал столицей Литвы до прихода Советской власти. Не успел город забыть 1-ю мировую войну, как началась 2-я мировая. Теперь немецкие солдаты были фашистами по мировоззрению. Они терроризировали местное население, а 9-й Форт превратили в концлагерь. Там сейчас находится мрачный музей.
Когда война завершилась, Каунас стал отстраиваться и разрастаться. С 1956 по 1959 год построили гидроэлектростанцию.
Если после Великой Отечественной Войны город развивался, то с 1991 года Каунас стал умирать. Постоянный рост безработицы вынуждает многих жителей уезжать за пределы Независимой Литовской Республики.