Первые социальные потрясения были вызваны конкретной экономической политикой, которую проводило правительство Морозова. Оно вошло в историю под названием соляного бунта. В 1646г. правительство ввело новые налоги на соль. Недовольные этим потребители и торговцы высказали свои пожелания правительству. В 1647г. новые налоги на соль отменили. Стремясь компенсировать потери, правительство урезало жалование служилым людям по прибору - стрельцам и пушкарям. В 1648г. начался Соляной бунт. Толпа остановила возвращавшегося с богомолья царя и предъявила ему ряд требований. Начались погромы боярских усадеб, восставшие требовали выдать им Морозова (фактически руководил всей работой государственного аппарата), Плещеева (глава Земского приказа), Траханиотова (глава Пушкарского приказа). Царь сумел отстоять свояка боярина Морозова, толпа разорвала на части Плещеева и Траханиотова. Морозова отправили в Кирилло-Белозерский монастырь. В это время начались восстания в других городах. Самые крупные из них были восстания в Пскове и Новгороде, вызванные поставками хлеба в Швецию. Они были очень быстро подавлены правительством.
В 1661г. дабы компенсировать потери от войн со Швецией и Польшей правительство ввело медные деньги, которые приравнивались к серебряным. Налоги нужно было платить серебром, а торговать - медью. Крестьяне просто перестали везти продовольствие в города. Медные деньги стали резко обесцениваться, недовольство народа нововведением росло до тех пор, пока не вылилось в восстание. Выступление против медных денег в 1662г. было названо Медным бунтом. Царь находился в Коломенском, к нему пришла толпа с требованиями выдать неугодных народу бояр. Восстание жестоко подавили прибывшие в Коломенское стрельцы. Они многих людей изрубили, других - утопили. Таким образом, восстание было подавлено. Медные деньги пришлось изъять из-за полного расстройства финансовой системы. Правда, за один рубль меди давали всего 2 деньги (в рубле было 200 денег). После расправ над бунтовщиками стрельцов правительство приказало повесить 150 человек, других клеймили, ссылали на далёкие окраины.
Медный бунт, потрясший царя Алексея Михайловича, оказался ничтожен в сравнении с тем народным пожаром, который разгорелся спустя несколько лет на Дону. В 1666г. начались события, которые собственно и дали название XVII в. как "бунташному". Казаки, составлявшие в то время основную часть населения Дона, под предводительством Василия Уса направились к столице, грабя по пути усадьбы бояр и дворян, практически дошли до Тулы, но повернули назад, боясь встречи с регулярными войсками
В 1667г. начались события, которые получили название крестьянской войны под предводительством Степана Разина. Он был казаком станицы Зимовейской, знал калмыцкий и татарский языки и выступал в роли переводчика. Разин участвовал в походах против Крыма. Русское правительство не желало в условиях войны с Речью Посполитой (1654-1667) развязать и военные действия с Крымом, запретило казакам воевать с ним. Самое благодатное направление грабежа и разбоя было закрыто для казаков, те устремились к Каспию и Закавказью. В 1667г. Разин начал свой знаменитый поход за "зипунами" (очевидно, это ковры). Собрав 1тыс. казаков, он захватил Астрахань, дошёл до Персии, захватил Дербент, Баку. Этот поход закончился в 1669г. Таким образом, 1667-1669гг. - первый этап выступлений Разина завершился. Это был просто грабительский поход, назвать его крестьянской войной нельзя.
Второй этап 1670-1671гг. дал основания историкам назвать походы Разина крестьянской войной. В 1670г. Степан Разин решил выступить против бояр-изменников. Он стал рассылать в различные районы страны т.н. "прелестные письма", в которых говорил, что выступает за царя против бояр-угнетателей. В 1670г. он решил идти в новый поход по Волге, но только не к Каспию, а вверх по течению - на север. Отряд Степана Тимофеевича численностью 7тыс. человек подошёл к Царицыну. Жители города добровольно впустили Разина с отрядом, он в свою очередь ввёл казачье устройство в Царицыне (всех жителей распределили по десяткам и сотням, вместо воеводы назначил городового атамана). Из Астрахани против Степана Разина был направлен отряд стрельцов, однако "астраханские ратные люди великому государю изменили и сами пристали к нему (Стеньке Разину), с ним бою не учинили". Так Степан Разин беспрепятственно подошёл к Астрахани, жители сами отдали город в распоряжение казакам.
Затем Разин двинулся вверх по Волге, на его сторону добровольно перешли Саратов и Самара. Ряды восставших множились, к Разину примыкали беглые крестьяне, холопы, другие казачьи отряды. На подавление восстания было направлено 60тыс. стрельцов и служилых людей. В то время как повстанцев насчитывалось 20тыс. человек. Потерпев поражение, Разин бежал на Дон. Его выдали царским войскам свои, не так давно преданные казаки во главе с Корнеем Яковлевым. Летом 1671г. Разина четвертовали на Красной площади. Правительство торжествовало победу. Участники восстания подверглись жестоким преследованиям. В одном только Арзамасе в течение трёх месяцев было казнено свыше 11тыс. человек.
Причинами поражения были стихийность, неорганизованность, социальная ограниченность восставших. В советской историографии восстание Разина назвали крестьянской войной, но, во-первых, крестьянство в восстании почти не участвовало, во-вторых, антифеодальные лозунги появились лишь на втором этапе и то, как вынужденная мера. В последнее время восстание Разина все чаще характеризуется только как "восстание". Крестьянской войной его можно назвать в том смысле, что в целом оно было направлено против существующей системы, а главным угнетаемым классом было крестьянство. В ходе кровавого мятежа Разина казачество попыталось низвергнуть установившийся в России государственный порядок и утвердить своё правление. Но и в случае своей победы, перебив бояр, воевод, помещиков и приказных, восставшие не смогли бы создать новое справедливое общество. Неизбежно, раньше или позже, из самой казачьей среды должны были появиться новые землевладельцы, приказные. Но прежде чем жизнь России вошла бы в обычную колею, она была бы залита кровью, отброшена далеко назад в своём развитии.
Самым главным социальным движением XVII в. был т.н. церковный раскол - крупнейшее событие не только в церковной, но и в политической жизни России. XVII в. в Европе характеризуется как век модернизации феодального общества, английской революции, появление буржуазно философских доктрин. Инквизиция как символ средневековья уходит в прошлое. Несмотря на изоляцию России, перемены в Европе не могли не оказывать воздействие на русское общество. Отношения между церковью и государством в XVII в. вступили в новую стадию. Именно благодаря деятельности православной церкви во многом произошло образование русско-московского централизованного государства, и это государство сохранило свою независимость в смутное время (патриарх Филарет).
В течение XV-XVI вв. место церкви в политической истории определилось спором между иосифлянами и нестяжателями. Спор был разрешён при помощи государства. Новая династия Романовых утвердилась во многом благодаря патриарху Филарету, который именовался "Государем Всея Руси". Но после Смуты в русской православной церкви накопилось значительное количество проблем, на первый взгляд – формальных. После падения Византии как государства, в Москву бежало значительное количество греческих монахов, которые естественно привезли с собой церковную литературу. В результате притеснения православных с Украины пришло значительное число священников, появились разночтения в христианской литературе. Большое влияние оказывал Запад.
В этих условиях в 40е гг. в Москве вокруг царского духовника Степана Вонифатьева сложился кружок ревнителей древнего благочестия. Они выступили против произвольного сокращения церковной службы и беспорядков во время богослужения, обличали такие пороки духовенства, как пьянства, разврат мздоимство, против проникновения светских начал в духовную жизнь. Выступили с программой исправления церковных книг и унификации церковных обрядов. Главную роль играли Новгородские митрополит Никон и протопоп Аввакум. Первоначально члены кружка взяли за образец древнерусский текст, но выяснилось, что и там нет единства. Правительство Алексея Михайловича всё-таки желало установить контакты с Европой и, став в 1651г. патриархом, Никон взял за образец греческие книги. Собранный в 1652г. Церковный Собор одобрил нововведение. Члены кружка, выступившие против, были сосланы. Никона поддержал и царь.
Сначала между царём и патриархом установились дружеские отношения. В отсутствие царя Никон фактически управлял и, так же, как и Филарет, стал именоваться "Государем". Но вскоре между ними произошёл раскол. Никон выступил с программой "цезарепапизма", суть которой заключалась в независимости и даже превосходстве духовной власти над светской. Царь перестал приглашать патриарха на приёмы в Кремль. Никон объявил о снятии сана и отъезде в монастырь, будучи уверенным, что Государь сам будет просить вернуться его. Но этого не произошло. В 1666г. Церковный Собор низложил Никона и отправил в монастырь.
В результате церковного раскола возникло новое социальное движение – старообрядчество. Его нельзя сравнить ни с одним религиозным движением Западной Европы. Старообрядцы выступали за чистоту древнерусской веры, сохранение книг и обрядов. Среди старообрядцев были представители практически всех социальных групп: бояре (Морозова), дворяне, стрельцы, крестьяне, посадники. Причиной столь глубокого раскола была исключительная религиозность российского общества и быстрота проводимых Никоном реформ.