Среди основных мер по сохранению биоразнообразия важное место занимает Красная книга. "Красная книга"— аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов. Красные Книги бывают различного уровня— международные, национальные и региональные. Первая организационная задача охраны редких и находящихся под угрозой исчезновения видов— их инвентаризация и учет как в глобальном масштабе, так и в отдельных странах. Без этого нельзя приступать ни к теоретической разработке проблемы, ни к практическим рекомендациям по спасению отдельных видов. Задача не простая, и ещё 30-35 лет назад предпринимались первые попытки составить сначала региональные, а затем мировые сводки редких и исчезающих видов зверей и птиц. Однако сведения были или слишком лаконичны и содержали лишь перечень редких видов, или, напротив, очень громоздки, поскольку включали все имеющиеся данные по биологии и излагали историческую картину сокращения их ареалов. Ведение Красной книги Российской Федерации — это постоянная работа по мониторингу редких и исчезающих видов, по реализации упомянутых организационно-правовых гарантий.
Исчезающие виды, занесенные в Красную Книгу, становятся объектом экологической политики страны. Для их сохранения создаются заповедники или национальные парки. Запове́дник - это охраняемая природная территория, на которой под охраной находится весь природный комплекс, где запрещена любая человеческая деятельность, кроме научных исследований. Даже доступ людей туда крайне ограничен. Национальный парк, в отличие от заповедников, где деятельность человека практически полностью запрещена (запрещены охота, туризм и т. д.), на территорию национальных парков допускаются туристы, в ограниченных масштабах допускается хозяйственная деятельность. Система государственных заповедников России на 1.01.96 включает 93 заповедника, которые охраняют 30 млн. га, или почти 1,5% от всей площади России, что превышает территории Белоруссии, Латвии и Эстонии, вместе взятых. Национальных парков на территории страны всего 39. Управление системами заповедников. В начале ХХ века научная общественность заставила правительство обратить внимание на проблему сохранения хотя бы небольших участков дикой природы. Тогда во всех странах мира стали создаваться заповедники. Казалось, что достаточно отвести определенную территорию, не допускать туда человека, и заповедные объекты будут существовать вечно. В мировой практике есть случаи, когда создание заповедников наоборот ускоряло вымирание вида. Так, туранский тигр исчез с лица земли через 34 года после открытия заповедника "Тигровая балка", леопард на территории кавказского заповедника исчез через 24 года. В этих случаях звери ещё некоторое время сохранялись вне заповедников. Время существования вымирающего вида сократила замкнутость заповедного пространства.
Эта же замкнутость может влиять по-другому. В Йеллоустонском национальном парке обитали медведи гризли. Они не исчезли, но ученые заметили, что на протяжении пяти поколений медведи начали заметно мельчать. Можно провести аналогию: островные формы биовидов всегда мельче материковых. Например, на островах Зондского архипелага известны карликовые виды носорога, буйвола, а на Средиземноморских островах даже карликовые виды африканской фауны.
Замкнутость пространства ещё говорит об ограниченности численности животных, особенно, когда речь идет о крупных животных. Это подвергает охраняемые виды такой опасности как инбридинг (близкородственное скрещивание). Из-за этого во Французском заповеднике погибли лошади Пржевльского. Однако, известна и другая сторона: если вид не ограничен в пространстве расселения, то биовид может начать свою популяцию даже с десятка особей. Всего лишь пять особей ондатры, завезенных в Европу, дали начало популяции.
Ещё нормальному размножению животных на заповедных территориях может помешать крайность отношений между особями. Считалось,что достаточно посадить в клетку самца и самку, и размножение обеспечено. На практике оказалось, что животные не замечали разнополости, своеобразная любовь в животном мире (да, чувство любви можно приписать не только человеку), либо относились друг к другу настолько агрессивно, что их приходилось рассаживать в разные клетки.
Для того, чтобы гарантировать сохранение биовидов на своей территории, заповедник должен быть правильно спроектирован. В первую очередь важен расчет площади пространства, чтобы животные не были ограничены в личной территории, и могли себя чувствовать свободно столько особей, сколько необходимо, чтобы свести к минимуму близкородсвенное скрещивание (это определяется генетикой, данные колеблются от 50 до 100 особей) плюс такое же пространство должно быть у предполагаемого приплода охраняемого вида. В нормальных условиях каждое животное имеет свой индивидуальный охотничий участок. Для зверя важна не площадь, а то, что она содержит: наличие укрытий, количество пищи и отсутствие беспокоящих факторов. К примеру, тигру требуется популяция кабанов не менее, чем 250 особей, которым в свою очередь тоже необходимо достаточно пищи. При планировке заповедника важно брать максимальное значение индивидуального охотничьего участка. Ведь количество пищи может меняться с годами, и иногда меняться в разы, а животное обычно неохотно идет на расширение индивидуального охотничьего участка, это связано с "боевыми" столкновениями с соседями и приходится затрачивать больше энергии на поиски добычи, поэтому животное старается не переходить границы этого пространства, питаясь чем-нибудь другим. Так в тайге часто хищники переходят на питание кедровыми орехами. Таким образом, общая площадь заповедника должна равняться сумме максимальных площадей индивидуальных охотничьих пространств. Напрашивается только один вывод: чем больше площадь заповедника, тем на более длительное время мы сохраним вымирающие виды.
Куршская коса - одно из крупнейших аккумулятивных образований на восточном побережье Балтийского моря. Это место занесено в список Всемирного Наследия как международный Российско-Литовский культурный комплекс. По географическому положению и рельефу Коса является уникальным образованием. Главные элементы местности дюнные комплексы, одни из самых высоких в Европе (до 68 м в высоту), протянутые вдоль полуострова длиной более 70 км.
Из-за своего географического положения и ориентации с юго-запада на северо-восток Куршская Коса стала "направляющей линией" для мигрирующих видов птиц. Вдоль косы идут миграции птиц из северо-западной России, Финляндии и восточно-балтийских стран в среднюю и южную Европу. Каждую весну и осень вдоль косы пролетает 10-20 миллионов птиц, а значительное число из них останавливается здесь для отдыха и питания. На Косе, которая называется балтийской пролётной дорогой, дважды в год концентрируются птицы из заповедников на побережье Белого моря. Среди этих птиц немало редких и угрожаемых видов, занесённых в Красные книги России, Европы и мира.
Ландшафты Куршской косы сформировались в результате не только чисто природных процессов, но и человеческой деятельности. Это пример гармоничного взаимодействия природы и людей. Племя куршей, когда-то населявшее Косу, исчезло, но его этнографическое наследие всё ещё заметно. Ландшафт с засыпанной в 18-19 вв дюнным песком деревней мало отличается от современного. Коса богата следами культурного наследия. Защитные инженерные сооружения уникальны по своим размерам и вообще имеют большое значение в плане истории, науки и искусства. Рыбацкие деревни, археологические объекты и религиозные архитектурные постройки естественно интегрированы в ландшафт. Куршская коса - удивительный природный феномен, которому по пейзажной красоте нет равного во всём балтийском регионе. Разнообразный и сильно диверсифицированный дюнный рельеф в сочетании с зеленью лесов, яркой белизной песчаных пляжей и бескрайним простором Балтийского моря, всё это создаёт высокую эстетическую ценность.
Сейчас положение России такое, что ей не до заповедников, которые в представлении обывателя нужны для неведомого, чуждого ему будущего. Политика властей в области природопользования и охраны природы проста и прозрачна: устранять всё, что мешает развитию капитализма. В ежегодных посланиях Президента Федеральному Собранию, экологические проблемы даже не упомянуты. Кажется, что они замалчиваются потому что их обсуждение всё чаще вскрывает факты содействия властей бизнесу в его притязаниях на право безраздельно распоряжаться природой. В 2003-2004 годах проблема захвата земель противостояли 8 государственных природных заповедников и 4 национальных парка. Почти все эти попытки инициировались или поддерживались местной администрацией. Особенно пострадали национальные парки "Башкирия" и "Югыд ва". На из территориях развернули строительство водохранилищ, разрабатывают полезные ископаемые.
Утвержденный в 1994 году план об организации заповедников не был выполнен и на 1/3! Из 114 было построено лишь 23, а с 2001 по 2006 было не создано ни одного!
Ситуация улучшилась в 2007 году: было построено около 5 заповедников на востоке. Численность вольной популяции зубров в европейской части России достигла 150 особей, стабилизировалась численность амурского тигра, WWF ведет мониторинг состояния популяции белого медведя на Чукотке. Так же в 2007 году Россия вышла на 1 место в Европе и 2 в мире по площади лесов – 17 млн га.