В заповеднике произрастает 20 эндемических видов, в том числе 10 высокогорных эндемиков, 7 - скальных и 3 эндемика широколиственных лесов; 28 видов растений являются реликтами минувших геологических эпох, из них 6 видов — третичного возра-ста и 22 — ледникового.
Горный рельеф заповедника и значительная высота хребтов предопределяют высотную дифференциацию климатических условий и связанную с этим высотную поясность растительного и почвенного покрова. В заповеднике на склонах наиболее высоких хребтов - Ямантау, Зигальга, Машак и Нары — выражена высотная поясность растительности. На высоте от 650 до 1000 м над уровнем моря располагается горнотаежный пояс, образованный пихтово-еловыми лесами.
Выше него — на высоте 1000 - 1200 м — находится подгольцовый пояс, растительность которого представлена еловыми низколесьями, березовыми криволесьями и горными лугами. На наиболее высоких вершинах выражен горнотундровый пояс с участками горных тундр среди массивов гольцов.
Растительность заповедника представлена в основном лесами. На западе распространены смешанные широколиственно-темнохвойные леса, в центральной части и на востоке — темнохвойные елово-пихтовые леса, на юге — светлохвойные сосновые леса. Значительная площадь занята вторичными березовыми и осиновыми лесами. Участки высокогорной растительности - горные тундры и подгольцовые луга занимают небольшие площади.
На территории заповедника установлено обитание 275 видов позвоночных животных, в том числе 48 видов млекопитающих, 198 - птиц, 6 -пресмыкающихся, 4 — земноводных и 18 видов рыб. В лесах заповедника из млекопитающих обычны лось, медведь, волк, куница, белка, заяц-беляк; из птиц — глухарь, рябчик, пестрый и черный дятел, кукушка, и мелкие воробьиные птицы. В горных реках и ручьях обитают хариус, форель, таймень, быстрянка, подкаменщик. Из редких видов позвоночных животных, внесенных в Красную книгу РСФСР, в заповеднике обитают 3 вида птиц — беркут, орлан-белохвост, сапсан и два вида рыб — обыкновенный подкаменщик и европейский хариус. Фауна безпозвоночных изучена еще недостаточно. Выявлено 136 видов жужелиц, 43 — усачей, 25 — пластинчатоусых, 23 — щелкунов, 17 — долгоносиков, 10 — златок, 9 — мертвоедов, 66 видов бабочек, 21 вид полужесткокрылых (клопы-щитники), 3 вида прямокрылых (кузнечики), 86 видов журчалок, 13 видов божьих коровок, 15 видов стрекоз, 12 видов гельминтов рыб и 3 вида гельминтов амфибий. В заповеднике обитают 7 видов бабочек, внесенных в Красную книгу РСФСР. Заповедник служит местом обитания дикой бортевой пчелы[38].
К числу достопримечательных природных объектов на территории заповедника относятся геологические обнажения, признанные стратотипическими разрезами верхнего рифея Северной Евразии; Айгирские пороги на реке Малый Инзер, где ежегодно проводятся республиканские соревнования по водному туризму и скалолазанию; высокогорные болота и участки горных тундр на вершинах хребтов Зигальга, Машак и Нары — места обитания эндемичных и реликтовых видов растений; бортевые деревья — культурное наследие традиционного древнего промысла местного населения.
Одна из основных задач заповедника — охрана заповедной территории. Охрана заповедника осуществляется службой государственной лесной охраны, насчитывающей 85 человек, в их числе 65 лесников — инспекторов охраны. Служба охраны заповедника имеет в своем распоряжении высокопроходимые автомобили, используются также лошади. Для борьбы с лесными пожарами имеются 2 пожарные автомашины, гусеничный тягач и другая противопожарная техника.
Заповедник активно занимается эколого-просветительской деятельностью. Ведется большая эколого-воспитательная работа с учащимися школ района. Ежегодно заповедник посещают детские экскурсионно-туристические группы из городов республики. В течение 5 лет заповедник ежегодно участвует в международной акции «Марш парков», в рамках которого проводятся различные мероприятия, в том числе экологические фестивали, различные конкурсы детского творчества, викторины, КВН и др.
В заповеднике проходят практику студенты средних профессиональных и высших учебных заведений. С момента организации здесь ведутся научно-исследовательские работы по программе «Летопись природы и экологического мониторинга». Проведена инвентаризация флоры высших растений, лишайников, позвоночных животных. Выполнен ряд прикладных и экспериментальных работ. Заповедник тесно взаимодействует с Академией наук РБ и Уфимским научным центром РАН, оказывает содействие научно-исследовательским учреждениям и институтам в проведении исследований на своей территории. Статьи научных сотрудников природного парка опубликованы в нескольких республиканских и региональных научных сборниках.
Заповедник является членом региональных объединений особо охраняемых природных территорий (ООПТ) — Союза ООПТ Урала и Ассоциации ООПТ Южного Урала.
Заповедник достойно выполняет возложенные на него функции по сохранению генофонда растений и животных, природных сообществ и экосистем, а также стабилизации природной среды региона.
2.2 Национальный парк «Башкирия»
Национальный парк "Башкортостан" образован 11 сентября 1986 года. Скоро парк отметит 20-летие. Находится в юго-восточной части Башкортостана западнее от города Мелеуз. Площадь 79800 га составляет земли гослесфонда и 2500 га - акватория Нугушского водохранилища.
Территория парка издавна посещается туристами Башкирии и других регионов, ежегодно здесь бывает около 30 тыс. человек. Наиболее привлекательные места - реки Белая и Нугуш, Кутукское урочище, Нугушское водохранилище. Не менее привлекательно Нугушское водохранилище в зимнее время, когда проходит подледный лов рыбы. В урочище Кутук проложен туристический маршрут для спелеологов. Достопримечательностью маршрута являются карстовые пещеры[39].
Федеральное государственное учреждение «Национальный парк «Башкирия» является природоохранным, эколого-просветительским и научно-исследовательским учреждением.
Территория «НП «Башкирия» включает природные комплексы и объекты горных лесов Южного Урала. Они имеют особую экологическую, историческую и эстетическую ценность и предназначены для использования в природоохранных, просветительских, научных и культурных целях, а так же для регулируемого туризма.
Национальный парк «Башкирия» создан для сохранения уникального природного комплекса горных лесов Южного Урала и создания условий для развития организованного отдыха трудящихся и туризма.
Парк образован в 1986 г. как Государственный природный национальный парк «Башкирия» в Башкирской АССР», затем в 1995 году переименован в Национальный парк «Башкирия» и отнесён к особо охраняемой природной территории федерального значения.
Площадь национального парка составляет 82 300 га (в том числе 2 500 га акватории Нугушского водохранилища). Парк расположен на териитории трех районов республики Башкортостан – Мелеузовского, Бурзянского и Кугарчинского районов[40].
Протяженность НП «Башкирия» с севера на юг составляет около 30 км, с запада на восток – около 50 км. На востоке национальный парк граничит с государственным природным заповедником «Шульган-Таш», протяженностью около 40км.
Национальный парк «Башкирия» расположен на западных отрогах Южного Урала в междуречье рек Нугуш и Белая, а также прилегающих к нему с юга территориях восточного отрога Общего сырта и северной части Зилаирского плато.
Горы Южного Урала образовались более 250 миллионов лет тому назад. В течение последующих 200 миллионов лет горы подверглись сильным разрушениям под воздействием тектонических сил, и превратились в основном в плоскогорья.
Реки при поднятии гор углубляли долины и, устремляясь по трещинам и разломам, расчленили хребты глубокими ущельями. Результат всех этих воздействий – крайнее разнообразие и красоту ландшафта и рельефа парка.
Климат на территории НП «Башкирия» континентальный, и характеризуется относительно резкой изменчивостью и непостоянством погоды по отдельным годам, что особенно характерно для горной местности Урала.
В целом благоприятные климатические условия: мягкий континентальный климат, довольно значительное количество солнечных дней, продолжительный теплый период привлекают большое количество любителей активного отдыха и вполне благоприятны для произрастания лесных видов древесно-кустарниковой растительности.
Гидрографическую сеть территории составляют горные реки: Белая, Нугуш, Иргизла Кужа, Урюк, Юмагузинское и Нугушское водохранилище, а так же многочисленные ручьи с прозрачной чистой водой.
Основной водной артерией на территории парка является р. Белая (1430 км) – приток второго порядка р. Волги. Протяженность реки в пределах парка составляет около 110 км и здесь она не судоходна.
Река Нугуш (235 км) протекает в северной части парка, в пределах территории имеет протяженность около 80 км. В весеннее время – бурная и опасная река, в летнее время, в межень – труднопроходимая из за многочисленных перекатов. Средняя глубина в межень – 1м. На плесах, на перекатах – 0,3 – 0,5м, в ямах под скалами – до 5 м. Ширина русла составляет 10–30 м. Долина неширокая, 100–200 м.[41]