Этот год принес Петру Францевичу Лесгафту еще и степень доктора медицины и хирургии за сочинение «Колотомия в левой поясничной области с анатомической точки зрения» .В сентябре он получил сообщение ,что он избран по конкурсу на медицинский факультет Казанского университета и утвержден экстраординарным профессором физиологической анатомии .В Казани Лесгафт пробыл 3 года .Он был учредителем Общества естествоиспытателей при Казанском университете ,ему принадлежит идея создания антропологического музея ,организация экспедиций для его пополнения ,открытие лектория по современным проблемам науки .Но через 3 года Л. по велению царя уволили из Казанского университета без права преподавания .Поводом послужил конфликт с профессором А.В.Петровым ,который самовольно принял экзамены у студентов вместо Лесгафта .Изгнание блестящего профессора взбудоражило весь город .Студента вывешивали прокламации в защиту Лесгафта ,а 7 лучших профессоров университета положили свои заявления об отставке на стол ректора .
24 октября 1871 г. ,оставив жену и сына в Казани ,Лесгафта выехал в Петербург .Там ему пришлось согласиться на единственную работу ,которую мог предложить ему Грубер ,-частным порядком изготавливать анатомические препараты для ветеринарного отделения .Это дало скудные средства к существованию .Он начинает посещать лекции профессора М.М.Руднева по патологической анатомии и изучает гистологические препараты .Антропология давно занимала Петра Францевич Лесгафта и он пишет большую статью «Задача антропологии и метод ее изучения» ,которая привлекла новизной и оригинальностью взглядов автора на совсем еще новую отрасль знания .Петр Францевич Лесгафт понимал антропологию как науку о человеке ,которая рассматривает не только строение ,развитие и отправление различных органов и тканей человека ,но и влияние на него окружающей среды .Л. писал : «Познать человека ,направить и оценить его действия мы можем только тогда ,когда ,понимая строение его организма ,мы хорошо будем знать влияние на него всех внешних условий ,как физических ,так и нравственных».Материалистическое понимание неразрывной связи человека с окружающей внешней средой ,с воздействием этой среды на анатомическое строение органов и тканей и на их функцию составляло сущность нового ,прогрессивного учения ,получившего вскоре отражение в «функциональной анатомии» ,создателем и блестящем представителем которой явился Петр Францевич Лесгафт .
Зимой 1871/72 г.г. он делал еще первые шаги на этом новом пути ,прославившем затем его имя .Неопределенность положения «профессора без кафедры» заставляла его не раз обращаться с прошением в Медицинский департамент для принятия его на службу .Наконец ,27 апреля 1872 г. он был определен сверхштатным младшем чиновнике при Медицинском департаменте и летом того же года направлен на борьбу с холерой ,вначале в Киевскую ,а затем в Могилевскую губернии .Л. успешно справился с порученным ему делом :сумел быстро выявить и изолировать заболевших ,убедил жителей деревни соблюдать правила гигиены .
После возвращения Л. вновь занялся анатомическими исследованиями ,опубликовал ряд интересных работ по анатомии в медицинских журналах .К этому времени относится начало его работы над теорией и практикой физического образования ,над созданием научных основ педагогической и лечебной гимнастики .Изучая анатомические особенности органов движения ,он вновь и вновь убеждался в теснейшей связи формы органа с его функцией :развивается и крепнет только тот орган, который активно функционирует. Если орган не тренировать ,не давать ему нагрузку ,то он неизбежно слабеет и атрофируется
Анатомо - физиологическая сущность человека определяется его деятельностью. Только постоянная деятельность утверждает и поддерживает в человеке его специфические качества и свойства .Вот почему упражнения ,тренировку органов и систем Л. считал необходимой .предпосылкой для их нормального функционирования ,для здоровой и активной жизни человека .
В сентябре 1872 г. Л. начинает работать в качестве консультанта в гимнастическом заведении А.Г.Берглинда ,где он мог на практике осуществлять те принципы и представления ,которые впоследствии составляли научно- теоретические основы его рациональной гимнастики . «Только знание потребностей и возможностей человеческого организма ,-убеждал он ,-только научный подход к проведению любого вида гимнастики могут сделать ее веским орудием в совершенствовании человека ,как физическом ,так нравственном
Одновременно с работой в гимнастическом заведении Бергминда он занимается изготовлением препаратов ,проводит антропологические изыскания и анатомические исследования .А с неофициального согласия градоначальника ,он открывает у себя на квартире общеобразовательные курсы ,которые постепенно выросли в знаменитые курсы Лесгафта .
Но неожиданно из Министерства народного просвещения пришло распоряжение немедленного отстранения его от работы .Только после многочисленных прошений Грубера и самого Л. 7 октября 1874 г. Александр Второй разрешил Л. поступить «на службу по ученой части» .Однако минует 4 года ,прежде чем Л. признают вторым прозектором в Медико- хирургической академии ,и он сможет начать читать лекции ,и не только там .Осенью 1875 г. он начинает читать лекции на Владимирских курсах. Эти лекции вызвали много разговоров в столичном обществе .Петр Францевич Лесгафт отрицал всякое «божественное начало» и прочно связывал психические процессы с физиологическими .Такие идеи были признаны вредными ,и министр запретил дальнейшее чтение публичных Л. .
Тогда П.Ф. отдался новому ,захватившему его делу- разработке вопросов физического воспитания .Начало было положено в Гимнастическом институте Бергмана .Наблюдая за проведением занятий Л. вносил в них коррективы ,давал советы ,устанавливал последовательность и интенсивность нагрузке при отдельных упражнениях ,вел антропометрические исследования .Мало- помалу у него стал вырабатываться свой метод рациональной гимнастики ,который мог позволить добиться большего эффекта и был свободен от ряда ошибочных положений шведской ,немецкой и других систем гимнастики ,Петр Францевич Лесгафт обратился в Главное управление военно- учебных заведений (ГУВУЗ) с предложением своих услуг .И с декабря 1874 г. он начал занятия гимнастикой с воспитанниками Второй Петербургской военной гимназии ,а с 15 марта 1875 г. по просьбе директора гимназии Медицинский департамент принял Л. на должность чиновника для особых поручений .Первое»особое поручение»- поездки заграницу «для подробного ознакомления с педагогической гимнастикой и с учреждениями для специального приготовления учителей этого искусства» .В остальное время он продолжает специальные занятия по немецкой ,шведской системам ,а также по системе ,предложенной им самим .
В течение 2-х лет он объездил 13 европейских государств ,побывал в 26 городах ,где посетил все учреждения для специальной подготовки учителей гимнастики .Он присутствовал на занятиях ,беседовал с педагогами ,медицинскими работниками ,изучал устройства гимнастических снарядов и даже давал свои рекомендации по улучшению их конструкций .В конце каждого года он представлял в ГУВУЗ отчет о командировке .Один такой отчет был опубликован в виде отдельного приложения под названием «Приготовление учителей гимнастики в государствах Западной Европы» .Выводы ,сделанные Петром Францевичем Лесгафтом в отчете, подчеркивали ,что в основу физического воспитания должны быть положены законы анатомии и физиологии человека .Важнейшим условием успешного преподавания гимнастики он считал соблюдение строгой последовательности в дозировке нагрузки ,обязательный учет индивидуальных способностей учащихся . Петр Францевич добивается организации 2-х годичных учебно- гимнастических курсов ,которые открылись в сентябре 1877 г. при Второй Петербургской военной гимназии .На них Л. читал лекции по анатомии и руководил на 2-ом курсе всеми практическими занятиями ,включая гимнастику и фехтование .Практические задания по физике ,химии ,гигиене и анатомии проводились в лабораториях и кабинетах Медик- хирургической академии ,а курс лекций по физиологии читалИ.М.Сеченов ,который до конца жизни поддерживал дружеские отношения с Петром Францевичем Лесгафтом.
По сути дела Л. сумел создать настоящий институт по подготовке специалистов физического воспитания .Но началась русско- турецкая война ,курсы были закрыты .Было выпущено только 14 учителей ,которые заняли преподавательские должности в военных гимназиях Петербурга ,Москвы ,Киева ,Орла и других городов .Все они получили подробные инструкции ,которые были составлены Л. .В них он сформулировал 3 принципа проведения занятий Первый принцип состоит в постепенности и последовательности. Только при соблюдении его можно добиться хороших результатов .Второй- необходимость отчетливого представления исполнителем ,что он должен сделать ,чего достичь .Наконец ,третий принцип- соответствие физических упражнений анатомо- физиологической структуре организма .
Весь процесс образования П.Ф. также разделял на 3 этапа .Первый этап заключается в обучении ребенка правильным движениям .Второй- состоит в постепенном увеличении нагрузки с учетом физиологических особенностей подростка .Третий этап- обучение умению точно рассчитывать свои силы во времени и пространстве .Система образования П.Ф.Лесгафта не смогла в то время получить большого распространения в России .Лишь много лет спустя основы физического образования, им разработанные, были оценены по достоинству и многие его элементы включены в систему преподавания.
В начале 1876 г. (по некоторым источникам в 1877 г.) П.Ф. было разрешено баллотироваться на должность второго прозектора ,и большинством голосов был избран на эту должность .Он опять начинает работать на кафедре Грубера ,где за 20 лет работы (1861- 1868 и 1871- 1885 г.г.) провел большое количество исследований по анатомии .Он опубликовал свыше 20- ти оригинальных работ ,под его руководством были выполнены 22 диссертации. Работа увлекала и радовала Л. .Улучшилось его материальное положение и бытовые условия .Окрыленный ,Л. испытывал большой творческий подъем и чрезвычайно трудился над собственными исследованиями .