8. http://www.bioinformatix.ru – сайт содержащий информацию о биоинформатике, геномике, протеомике, анализе медицинских и биологических изображений, биософте. Недостаток: сайт ориентирован на освещение событий на территории Российской Федерации.

9. http://cran.r-project.org – сайт посвящённый языку программирования R для статистической обработки данных и работы с графикой, а также свободная программная среда вычислений с открытым исходным кодом в рамках проекта GNU. Статистические возможности R полностью покрывают возможности MatLab.

Действующий личный сайт в WWW

http://eugenia-lisitsa.narod.ru

Граф научных интересов

магистранта Лисицы Е.В. факультета радиофизики и электроники

Специальность радиофизика

Смежные специальности

05.13.11 – математическое и программное обеспечение вычислительных машин, комплексов и компьютерных сетей

1. Математическое и программное обеспечение систем искусственного интеллекта, мультимедиа, принятия решений, функционального и логического программирования, баз данных, знаний и экспертных систем 2. Создание системного математического и программного обеспечения, методов построения операционных систем, обеспечивающих эффективное использование ресурсов в ВМКСиС.

Основная специальность

05.00.13 – системный анализ, управление и обработка информации, физ.-мат., техн.

1. Методы и алгоритмы решения задач системного анализа, оптимизации, управления, принятия решений и обработки информации. 2. Специальное математическое и программное обеспечение систем анализа, оптимизации, управления, принятия решений и обработки информации. 3. Визуализация, трансформация и анализ информации на основе компьютерных методов обработки информации. 4. Методы получения, анализа и обработки экспертной информации.

Сопутствующие специальности

05.11.07 – оптические и оптико-электронные приборы и комплексы, физ.-мат.

1. Методы, оптические и оптоэлектронные приборы для формирования и обработки оптических изображений. 2. Лазерные и оптические комплексы для медицинских и биологических применений. 3. Оптические и спектроскопические аналитические методы, приборы и комплексы для экспресс-диагностики в медицине, управлении технологическими процессами, для контроля состояния окружающей среды.

03.00.25 – гистология, цитология, клеточная биология

1. Системный анализ взаимоотношений клеток и тканей в организме. 2. Разработка цитологических и гистологических методов исследования и экспериментальных моделей для изучения структурной организации и жизнедеятельности клеток и тканей.

Тестовые вопросы по Основам информационных технологий

<text>1 Какой из перечисленных ниже атрибутов устанавливает положение таблицы по отношению к полям документа</text>

<answer id="1" right="0"> WIDTH </answer>

<answer id="2" right="0"> BORDER </answer>

<answer id="3" right="1"> ALIGN </answer>

<answer id="4" right="0"> CELLSPACING </answer>

</answers>

</question>

<text> 2 Основные отличия ImageJ от других пакетов бесплатного программного обеспечения</text>

<answer id="1" right="1"> Возможность внедрения пользовательских плагинов </answer>

<answer id="2" right="0"> Не требует навыков программирования для разработки плагинов</answer>

<answer id="3" right="1"> Возможность написания пользовательских макросов </answer>

<answer id="4" right="0"> Открытая лицензия, позволяющая распространять как платно так и бесплатно разработанные плагины. </answer>

</answers>

</question>

Презентация магистерской диссертации

Презентацию магистерской диссертации можно скачать по ссылке в Интернете или посмотреть в приложении.

Список литературы к выпускной работе

1. Феофанов, А. В. Спектральная лазерная сканирующая конфокальная микроскопия в биологических исследованиях/ А.В. Феофанов// Успехи биологической химии. т. 47. –2007. –С. 371-410.

2. Lamprecht, M. R. CellProfiler: free, versatile software for automated biological image analysis/ M. R. Lamprecht, David M. Sabatini, and Anne E. // Carpenter BioTechniques. –2007. – Vol. 42. –P.71-75.

3. Abramoff, M.D. Image processing with ImageJ/ M.D. Abramoff, P.J. Magalhaes, and S.J.Ram// Biophotonics International. –2004. –Vol. 11. – P. 36-42.

4. Ronneberger, O. Spatial quantitative analysis of fluorescently labeled nuclear structures: Problems, methods, pitfalls/ O. Ronneberger [et al.]// Chromosome Research. –2008. – Vol. 16. –P.523-562

5. Карнаухов, В.Н. Люминесцентный анализ клеток/ В.Н. Карнаухов. – Пущино: «Аналитическая микроскопия», 2002. – 131 с.

6. Штейн, Г. И. Конфокальная микроскопия: мифы и реальность/ Г. И. Штейн// Школа-семинар «Конфокальная микроскопия в биологии и медицине», –Москва 2005.

7. Абламейко, С.В. Обработка изображений: технология, методы, применение/ С.В. Абламейко, Д.М. Лагуновский. – Минск: «Амалфея», 2000. – 304 с.

8. Гонсалес, Р. Обработка изображений в среде MATLAB/ Р. Гонсалес, Р. Вудс, С. Эддинс. – Москва: Техносфера, 2006. –616 с.

9. Liao, P.S. A Fast Algorithm For Multilevel Thresholding / P.S. Liao [et al.] //Journal of Informational Science and Engineering. –2001. – Vol. 17, – P. 713-727.

10. Bishop, C. M. Pattern recognition and Machine Learning/ C. M. Bishop, –Springer, 2006. 735 pp.

11. Гилевский, С.В. Теория вероятностей и математическая статистика/ Гилевский С.В., Малофеев В. М. – Минск: БГУ, 2003. –174 c.

12. Vincent, L. Watersheds in Digital Spaces: An Efficient Algorithm Based on Immersion / L. Vincent and P. Soille. //IEEE Transaction on Pattern Analysis and Machine Intelligence. –1991. –Vol. 13, –P.583-598.

13. Пpепаpата, Ф. Вычислительная геометрия: Введение/ Ф. Пpепаpата, М.Шеймос. – Москва: Мир, 1989, –481 с.

14. Jones, T. R. Voronoi-Based Segmentation of Cells on Image Manifolds/ T. R. Jones// CVBIA, 2005.– P.535-543.

15. Carpenter, A. E. CellProfiler: image analysis software for identifying and quantifying cell phenotypes/ A. E. Carpenter [et al.]// Genome Biology. 2006. –Vol. 7. –P.100.1-100.10

16. Swedlow, J. R. Open source bioimage for cell biology/ J. R. Swedlow and Kevin W.Eliceiri// Trend Cell Biology. – 2009.–Vol. 19. –P. 656-660.

17. Лисица, Е. В. Сравнительный анализ методов сегментации биомедицинских изображений/ Е. В. Лисица// Сборник материалов 67-ой науч. конф. студентов и магистрантов БГУ. Минск. 2010.

Приложение

Презентация магистерской работы