Весной 2001 г. проблема партийного строительства стала актуальной и для партий, которые занимают правый фланг в политической жизни страны. В апреле-мае 2001 г. прошли съезды по самороспуску небольших партий либеральной ориентации — «Демократический выбор России», «Новая сила» и др. Работа по подготовке создания единой партии правых длилась около года и завершилась в начале 2002 г. В этом же году общественно-политическое движение «Яблоко» было преобразовано в партию «Яблоко».
Победа В. В. Путина на президентских выборах 2000 года привела к изменению тактики КПРФ: она сочла необходимым отказаться от открытой враждебности, наиболее ярко проявившейся весной 1999 г. в обвинении Президента Российской Федерации Б. Н. Ельцина в государственной измене и попытке реализовать импичмент.
Новая тактика КПРФ проявилась в двух установках: во-первых, в документах партии, в публичных выступлениях Г. А. Зюганова и других лидеров на длительный срок исчезли нападки на Президента Российской Федерации, и, во-вторых, фракция КПРФ в Госдуме заняла лояльную позицию, выразила готовность конструктивно сотрудничать с фракцией «Единство» в работе Государственной Думы. Это привело к тому, что две фракции поделили между собой почти 90% постов руководителей 28 комитетов нижней палаты. Следует отметить, что это решение ущемило интересы фракций ОВС, СПС и «Яблоко» и они в знак протеста в течение трех недель бойкотировали заседания Госдумы.
На протяжении всего 2000 г. и в январе—марте 2001 г. КПРФ сохраняла этот курс, что обеспечивало положительное отношение Госдумы к принятию пакета федеральных законов: о налоговой реформе, о реформе Совета Федерации и т. д. Лояльное отношение КПРФ к Президенту базировалось на двух факторах: во-первых, на факте взаимопонимания и сотрудничества с «партией власти» (так в российских СМИ принято именовать движение «Единство») и, во-вторых, на убеждении лидеров КПРФ в том, что В. В. Путин, его политика укрепления власти, возрождения России как великой державы отвечает интересам КПРФ, открывает возможность укрепить влияние левых сил на избирателей.
Однако уже в начале 2001 г. отчетливо проявился курс КПРФ на конфронтацию с Кремлем, который получил выражение в форме массовых демонстраций 1 мая и 9 мая 2001 г. В проведении этих демонстраций, помимо КПРФ, участвовали ее союзники по НПСР, «Трудовая Россия», «Конгресс советских женщин», «Союз российских офицеров», «Движение в поддержку армии». В двух манифестациях в Москве приняло участие свыше 40 тыс. человек; участники шествий несли транспаранты с призывами к борьбе против политики В. В. Путина и М. М. Касьянова, против пенсионной реформы, «грабительского» КЗОТа, распродажи земли.
Переход левых партий к активным действиям против власти привел в апреле 2002 г. к кадровым перестановкам в Госдуме, в результате которых за КПРФ (представители КПРФ, помимо спикерского кресла, возглавляли девять комитетов и пост председателя мандатной комиссии) предлагалось оставить два комитета — по культуре и делам религий. Сразу после голосования по пересмотру «пакетного соглашения» думские коммунисты и «аграрии» объявили о том, что в знак протеста против его результатов их представители удаляются от руководства вообще всеми думскими структурами. Представители КПРФ покинули председательские кресла оставленных им комитетов по культуре и туризму и по делам общественных организаций и объединений, а «аграрии» — Комитета по делам национальностей и мандатной комиссии. В свою очередь Г. А. Зюганов на состоявшейся пресс-конференции заявил, что «левые» не будут бойкотировать работу Думы, но перейдут в жесткую оппозицию нынешней власти и создадут теневое правительство.
В перспективе в партийном строительстве планировалось создание в России трехпартийной политической системы, предполагающей наличие в стране мощной партии власти, которая занимает центристские позиции и служит главной опорой политической системы. Предусматривается наличие оппозиции, но в отличие от оппозиции в любой западноевропейской стране, по мнению политтехнологов, у нее не должно быть шансов выиграть на очередных выборах, тем самым, создав возможность изменить курс страны. Оппозиция в такой схеме будет на двух противоположных флангах — левом и правом.
Эта стратегическая задача Президента и правительственной партии «Единство» была блестяще осуществлена на выборах в Госдуму и на президентских выборах. В декабре 2003 г. состоялись выборы в Государственную Думу ФС РФ четвертого созыва. В списки избирателей было включено 108,9 млн. избирателей. В выборах приняло участие 60,7 млн. избирателей, что составило 55,75% избирателей. К участию в выборах было допущено 40 политических партий и избирательных блоков. Пятипроцентный рубеж, необходимый для прохождения в Государственную Думу по партийным спискам, преодолели 3 партии (Единая Россия, КПРФ, ЛДПР) и один избирательный блок (Народно-патриотический союз «Родина»). Их лидерами были соответственно Б. Грызлов, Г. Зюганов, В. Жириновский, С. Глазьев с Д. Рогозиным. Главной неожиданностью выборов стало не прохождение в Думу праволиберальных партий — СПС и Яблоко, а также резкое, почти двукратное сокращение по сравнению с выборами 1999 г. голосов, поданных за КПРФ. За «Родину» проголосовало 9.02 % избирателей, принявших участие в выборах, ЛДПР — 11,45%, КПРФ — 12,61%, Единую Россию— 37,57%. Союз «Родина» получил по федеральному списку в Государственной Думе четвертого созыва 29 мест, ЛДПР — 36, КПРФ — 40, Единая Россия — 120. Правящей партией в новом составе Государственной Думы стала Единая Россия. Получив 120 мандатов по федеральному округу, 103 — по одномандатным избирательным округам, 23 — благодаря прошедшим в Думу при поддержке Генерального совета партии самовыдвиженцам. Единая Россия в общем итоге завоевала 246 депутатских мандатов.
Председателями всех 29 комитетов Госдумы стали представители Единой России. К концу января 2004 г. численность фракции «Единая Россия», которую возглавил лидер партии Б. В. Грызлов, оставивший к тому времени пост министра внутренних дел, достигла 306 человек, т.к. к ней примкнули некоторые беспартийные и представители других партий (СПС, Народной). Впервые в российской политической истории на основе партии-лидера было сформировано абсолютное парламентское большинство. Российская законодательная власть укрепилась на позиции политического центра.
Председателем Государственной Думы четвертого созыва стал Б. Грызлов (беспартийный). Первыми заместителями — А. Жуков (до марта 2004 г.) и Л. Списка. Оба — члены партии Единая Россия.
На IV съезде партии Единая Россия, состоявшемся в конце декабря 2003 г., Б. Грызлов заявил, что уверенная победа, одержанная партией на выборах в Государственную Думу, создала условия для выстраивания гармоничного союза двух ветвей власти — исполнительной и законодательной. Этот союз, по его словам, партия направит на достижение своей главной цели — повышения могущества России и роста благосостояния граждан.
На состоявшихся 14 марта 2004 года президентских выборах свое политическое волеизъявление продемонстрировало 64.4 % избирателей. В.В.Путин набрал 71.31% голосов, Н.М.Харитонов – 13.69%, С.Ю Глазьев – 4.1%, И.М.Хакамада –4.84%, О.А.Малышкин –2.02%, С.М.Миронов – 0.75%. Против всех проголосовало 3.45% (почти 2.4 миллиона избирателей).
За время очередного 2007-2008 электорального цикла система выборов претерпела серьёзные изменения: голосование должно было проходить по партийным спискам. По мнению многих наблюдателей, в том числе и иностранных, власть сделала всё, чтобы подменить голосование за партии при выборах депутатов V Государственной Думы 2007 года референдумом в поддержку Президента Путина В.В., который возглавил список «Единой России».
Было введено в действие то, что так тщательно готовилось и настраивалось все четыре года, а именно — машина воспроизводства своей власти. Административный ресурс: около 70 человек в списках «Единой России» заняли министры и губернаторы. По государственному телевидению ежедневно велась массированная прямая и скрытая агитация в пользу «партии власти». Был введен особый контроль для учета работников социальной сферы и силовых структур с целью командного голосования. Выдали около 1 млн. 600 тыс. открепительных талонов, в то время как таких талонов в 2003 году было 570 тыс . В 1999 году — 549 тысяч. На предприятиях использовались переносные урны, были организованы участки по месту работы. Велось голосование по паспортам без регистрации по месту жительства и открепительных удостоверений. Резко, на треть, подскочило число «прого-лосовавших на дому». К формированию результата были привлечены даже лица без определенного места жительства. Были брошены абсолютно все имеющиеся ресурсы, в том числе колоссальные превышающие миллиард рублей финансовые средства.
2 декабря 200г года из 109 млн. российских избирателей в выборах приняло участие около 70 млн. человек или 64 % всех избирателей страны
В итоге, по данным ЦИК, партия «Единая Россия» набрала около 45 млн., или 64.3 % голосов избирателей, т.е. формально набрала в 2 раза больше голосов чем в 2003 году. По мнению оппозиционных партий этот результат был получен исключительно за счёт использования административного ресурса.
КПРФ получила более 8 млн., или 11.6 % голосов. Партия ЛДПР получила более 5.6 %.: млн., или более 8 % голосов. Партия «Справедливая Россия получила 5.3 млн., или 7.7 % голосов. Таким образом в Государственной Думе подавляющее количество мест получила партия «Единая Россия» - 315, КПРФ – 57, ЛДПР – чуть более 40, «Справедливая Росси» - 38 депутатских мест.
На выборах Президента РФ в марте 2008 года Медведев Д.А. получил 70.28 % , Зюганов Г.А. – 17.72 %, Жириновский В.В. – 9.35 %, Богданов А.В. – 1.30 % голосов избирателей.