работа (стр. 2 из 2)

Рис. 4. Выравнивание межцистронных фрагментов S7-S12 из геномов, наиболее схожих с аналогичным участком генома E. coli. Фрагменты заканчиваются перед старт-кодоном белка S7.

Рис. 5. Выравнивание групп бактерий, наиболее схожих с E. coli по составу межцистронных фрагментов:

a) Enterobacteriaceae (в эту группу входит E. coli)

Фрагменты заканчиваются перед старт-кодоном белка S7.

Рис. 5. Выравнивание групп бактерий, наиболее схожих с E. coli по составу межцистронных фрагментов:

б) Salmonella

Фрагменты заканчиваются перед старт-кодоном белка S7.

По данным проведенного анализа можно предположить, что у бактерий семейства Enterobacteriaceae и Salmonella механизм аутогенной регуляции белком S7 собственного синтеза подобен E. coli, т.е. межцистронный фрагмент S12-S7 связывается с белком S7. Высокая степень гомологии соответствующих участков геномов бактерий группы Enterobacteriaceae связана только с генетической близостью данных представителей, и не доказывает, что механизм соответствующей регуляции других организмов идентичен E. сoli.

Например, почти полное отсутствие межцистронного участка у бактерий группы Bacillus свидетельствует о возможности другого механизма регуляции. Косвенное подтверждение этой возможности было получены биохимическими методами [1]

Выводы

1. Не смотря на высокую степень гомологии белков S7 эубактерий, межцистронные фрагменты S12-S7 str оперона демонстрируют значительную вариабельность.

2. Наиболее близкие к str оперону E. сoli участки имеются у членов семейства Enterobacteriaceae, к которым относится E. coli, и у Salmonella. Можно предположить, что механизм аутогенной регуляции белком S7 собственного синтеза у E. coli также присутствует и у бактерий семейства Salmonella.

3. Практически полное отсутствие межцистронной области S12-S7 в str оперонах бактерий группы Bacillus свидетельствует об отличном от E. coli механизме регуляции.

Список литературы

[1] Miyamoto, A., Usui, M., Yamasaki, N., Yamada, N., Kuwano, E., Tanaka, I. and Kimura, M. (1999) Eur J Biochem 266, 591-8.

[2] Saito, K., Mattheakis, L.C. and Nomura, M. (1994) J Mol Biol 235, 111-24.

[3] Saito, K. and Nomura, M. (1994) J Mol Biol 235, 125-39.

[4] Zengel, J.M. and Lindahl, L. (1994) Prog Nucleic Acid Res Mol Biol 47, 331-70.