Вокруг территории парадного двора в середине XX в. были сделаны многочисленные посадки клена татарского, лиственницы европейской, псевдоакации, березы бородавчатой и пушистой и других деревьев и кустарников. Те же породы одновременно были высажены и в других частях усадебного парка. С юго-запада парадный двор ограничен небольшим каменным двухэтажным флигелем, стилистически близким господскому дому и, видимо, одновременным ему. В разное время это здание называли по-разному: при Голицыных - кухня (или кухонный флигель), при Меншиковых - молочный дом, а при Якунчиковых - гостевой флигель, что отражает его изменявшиеся функции в 1914г.
Юго-западнее гостевого флигеля находится "двухэтажный дом с электричеством и квартирами служащих" - небольшое двухэтажное квадратное в плане здание, вполне вписывающееся в стилистику позднего классицизма. Опись Черемушек 1914 г. называет этот дом "новым". Из чего следует, что он приобрел вид, близкий к современному, в последний крупный дореволюционный строительный период в усадьбе в начале 1910-х гг., возможно, с использованием предыдущей постройки.
Впервые здание на этом месте - новый "Кухонный флигель" - было сооружено при Н.С. Меншикове в 1830-1840-х гг. Еще одно его название - детский флигель, видимо, относится ко временам Якунчиковых, так как у Н.С. Меншикова детей не было, а племянник В.А. Меншиков ко времени получения Черемушек был вполне зрелым человеком.
Ближе к пруду на одной линии со служебным флигелем расположено одно из самых интересных сооружений Черемушек - "Эрмитаж", классицистическое здание, центральная часть которого акцентирована портиками и куполом. Подкуполь-ный объем первоначально представлял собой двусветный зал, но ныне разделен на два этажа.
Названием "Эрмитаж" здание косвенно обязано Ю.И. Шамурину. В его книге "Подмосковные", изданной перед Первой мировой войной, при описании черемушкинских павильонов отмечено, что одно из традиционных использований таких редко имевших практическое назначение сооружений - "эрмитажи для отдохновения". В 1920-х гг. члены Общества изучения русской усадьбы соотнесли абстрактную метафору "эрмитаж" именно с этим зданием. Именно под этим названием оно оказалось включенным в литературу и официальные документы.
В списке памятников архитектуры Москвы, состоящих под государственной охраной, "Эрмитаж" имеет условную датировку - XVIII в. В переводе с канцелярского на общепринятый язык это значит, что Государственному управлению охраны памятников г. Москвы о здании точно ничего неизвестно. Во всяком случае, не исключено, что "Эрмитаж" был построен еще при Голицыных и, значит, может вместе с церковью считаться одной из самых старых построек Черемушек. Архитектурные особенности "Эрмитажа" доказывают, что он был сооружен не позднее 1780-х гг.
В литературе отмечено, что первоначально он являлся "Гротом". Однако это здание имеет специфическую планировку, более характерную для оранжерей: круглый центральный двусветный зал, декорированный колоннами, и примыкающие к нему два крыла. Безусловно, это могла быть не промышленная оранжерея, а парадная, по сути, парковый павильон, украшенный оранжерейными растениями, в котором могли проводиться торжественные приемы. Именно такими были Померанцевая оранжерея в Кузьминках, несохранившаяся оранжерея в Люблине и другие. Отметим, что при черемушкинском господском доме была каменная оранжерея, упоминаемая в описи 1783 г., а "Грот" не указан.
Здание неоднократно меняло свое предназначение и соответственно названия. После реконструкции "Грота" по инициативе Н.С. Меншикова оно стало называться ванный флигель. При Якунчиковых на пруду была устроена самостоятельная купальня, поэтому ванный флигель использовался как дачное помещение. Видимо, при этом в центральном зале были устроены перекрытия. В конце 1900-х гг. перед ним появился фонтан, увековеченный на картине П.И. Чешуина "Старый дом", экспонировавшейся в 1913 г. в Москве на выставке рисунков и набросков, исполненных на вечерах художественного кружка "Среда". Судя по ней, уже тогда большие окна были на две трети заложены, что, возможно, связано с размещением в здании Н.В. Якунчиковым усадебной библиотеки. В 1920-х гг. оно было расширено за счет небольшого объема, пристроенного со стороны пруда. Тогда же в этой части здания было устроено подвальное помещение, никак не связанное с ледником.
В конце 1940-х - начале 1950-х гг. юго-западнее "Эрмитажа" на берегу пруда было поставлено большое мрачное здание, сооруженное в псевдоклассицистических формах. Это один из институтских корпусов. Но большая часть институтских построек расположена в "запрудной" части усадьбы, куда можно попасть либо по арочному мосту, перекинутому через пруд в его юго-западной части, либо по дамбе, ограничивающей пруд с северо-востока. Этот пруд, имеющий правильную прямоугольную форму, около 1816 г. заменили два пруда, устроенные на русле речки Бекетовки. Именно тогда же были выстроены мост и плотина.
В "запрудной" части Черемушек усадебные постройки не сохранились. Некоторый интерес представляет только двухэтажный коттедж (сооруженный в конце 1940-х - начале 1950-х гг. для А.И. Алиханова) - незаурядное и, к сожалению, пока безымянное архитектурное произведение, недооцененное исследователями. Он поставлен на месте беседки, увековеченной этюдом М.В. Якунчиковой "Парк в Черемушках. Пруд". Вокруг коттеджа сохранилась часть липового парка, в которой встречаются отдельные экземпляры дуба черешчатого. Аналогичная растительность характерна и для основной территории парка.
От "Эрмитажа" дорожка, идущая по берегу пруда, мимо террасы, выводит к двум парковым павильонам: "Миловиде" и Чайному домику, отличающимся благородством и выразительностью форм. Некогда подобные павильоны украшали многие усадьбы, однако они дошли до нас в крайне незначительном количестве, поэтому черемушкинские павильоны уникальны своей сохранностью. Строительство "Миловиды" относится 1830-1840-м гг., то есть ко времени владения Черемушками Н.С. Меншиковым. Этот павильон напоминает собою "Миловиду" из подмосковной усадьбы Царицыно, сооруженную по проекту И.В. Еготова, отсюда и его условное название (в настоящее время сквозная арка черемушкинской "Миловиды" застроена). Типологически сходное сооружение одно время существовало и на территории усадьбы Петровско-Разумовское (ныне в черте Москвы).
Чайный домик (или Китайский павильон) - оригинальное парковое сооружение, выполненное в традициях раннего классицизма. Это небольшое одноэтажное здание, украшено рустовкой и пинаклями - декоративными башенками пирамидальной формы. Павильон был сооружен в 1780-х гг. в период активной застройки Черемушек С.А. Меншиковым и вместе с башнями "Экономии" отразил архитектурные искания того времени, воплотившиеся в "китайщине", о чем свидетельствуют и его названия. С определенными оговорками можно предположить, что проект этого здания выполнен Ф.-К.-Х. Вильстером, автором черемушкинского господского дома. Считается, что при Н.С. Меншикове в 1830-1840-х гг. оно было как бы одето в классицистический футляр - частично перестроено и оформлено портиками. Севернее когда-то имелся и третий павильон, на месте которого ныне находится непрезентабельное одноэтажное строение.
У павильонов проходит граница регулярной и, следовательно, наиболее старой части усадебного парка. Его центральная аллея выводит от Чайного домика к самой ранней постройке Черемушек - церкви Знамения Богородицы, памятнику развитого барокко типа "восьмерик на четверике", являющемуся также и первой каменной постройкой усадьбы. Ее фасады украшает нарядный декор. Компактный и симметричный объем церкви с высоким ярусным завершением, напоминающий, скорее, нарядный парковый павильон, чем культовое здание, был поставлен в усадебном парке вблизи старой дороги в Черемушки и обращен к ней северным фасадом.
Инициатива создания в Черемушках церкви принадлежала Ф.И. Голицыну, получившему 30 декабря 1742 г. разрешение на ее строительство. Надо думать, что церковь была сооружена в течение следующего 1743 г., так как тогда она уже значилась "новопостроенной" (Ю.И. Шамурин без ссылки на источник привел другую дату сооружения церкви - 1747 г., пока не подтвержденную документами. Известные по современной литературе даты - 1735-1739 гг. - ошибочны).
Хотя черемушкинская церковь сооружалась как приходская, после окончания строительства она вопреки существовавшему законодательству получила статус домовой, то есть стала чисто усадебной. Это значило, что право пользования ею принадлежало исключительно Голицыным. Все остальные жители Черемушек должны были по-прежнему ходить в церковь Николая Чудотворца в соседнем селе Никольском (Котлах). В 1772 г., когда имение находились в ведении аукциона, черемушкинская церковь была закрыта. Она снова стала действующей только в 1784 г. после перехода Черемушек к С.А. Меншикову, будучи "приписана" к церкви Троицы другого соседнего села Троицкого (Троицкое-Черемушки).
В конце XVIII - начале XIX вв. маленькую колокольню над входом в церковь заменили отдельно стоящей деревянной звонницей (документы называют ее "колокольнею на деревянных столбах"). К западу от входа в здание поставили небольшие ворота (не сохранившимся до наших дней) - уменьшенное и упрощенное повторение ворот, ведущих на парадный двор усадьбы. Примерно в то же время были расписаны интерьеры церкви. Вплоть до настоящего времени в литературе о Черемушках продолжают встречаться сведения о том, что росписи сохранились, хотя на самом деле из них ничего не уцелело.
При Якунчиковых церковь была либо переосвящена, либо в ней был устроен придел Спаса в честь религиозного праздника, по каким-либо причинам знаменательного для них, о чем свидетельствует новое название имения - Черемушки-Спасское, значащееся в ряде документов.