Ïîñëå âçðûâà åãî ñåìüÿ è îí ïåðååçæàþò íà Ôîíòàíêó. Ïàìÿòü î âçðûâå ÷àñòî òðåâîæèëà Ñòîëûïèíà, îí ïðèïèñûâàë âñþ âèíó ñåáå çà êðîâü è ñëåçû, çà èñêàëå÷åííûå æèçíè ëþäåé, ïîñòðàäàâøèõ îò âçðûâà. Íî âñêîðå îí íàøåë â ñåáå ñèëû, íå ïðåðûâàÿ ðàáîòû íè íà îäèí äåíü, ñòàë ãîòîâèòü íîâûå ðàçðàáîòêè ïî ñïîñîáàì ïîäàâëåíèÿ ðåâîëþöèîííîãî äâèæåíèÿ. Ïîñëå 12 àâãóñòà ïðåñòèæ Ñòîëûïèíà ïîäíÿëñÿ ñðåäè ìèíèñòðîâ. Äëÿ âñåõ îí ñòàë ïðèìåðîì ìîðàëüíîé ñèëû. Ñåìüå Ñòîëûïèíà íå äîëãî ïðèøëîñü æèòü íà Ôîíòàíêå, âñêîðå ãîñóäàðü ïðåäëîæèë Ñòîëûïèíó ïîñåëèòüñÿ â Çèìíåì äâîðöå, òàì áûëî ëåã÷å îðãàíèçîâàòü îõðàíó ñåìüè. Âåðíåìñÿ æå ê ïîêóøåíèþ, ðåàëüíûì ðåçóëüòàòîì ýòîãî æåñòîêîãî àêòà ÿâèëàñü áûñòðàÿ è áîëåå æåñòîêàÿ ðåàêöèÿ ïðàâèòåëüñòâà, Ñòîëûïèí ñäåëàë ìàêñèìóì óñèëèé äëÿ ýòîãî. 24 àâãóñòà 1906 ãîäà áûëà îïóáëèêîâàíà ïðàâèòåëüñòâåííàÿ ïðîãðàììà, êîòîðàÿ ñîñòîÿëà èç äâóõ ÷àñòåé - ðåïðåññèâíîé è ðåôîðìèñòñêîé.  íåé ãîâîðèëîñü, ÷òî ïðàâèòåëüñòâî ïðîòèâîïîñòàâèò íàñèëèþ ñèëó.  ìåñòíîñòÿõ, îáúÿâëåíûõ íà âîåííîì ïîëîæåíèè, ââîäèëèñü âîåííî-ïîëåâûå ñóäû ("ñêîðîðåøèòåëüíûå").  öåíòðå ðåôîðìèñòñêîé ïðîãðàììû áûë çíàìåíèòûé óêàç 9 íîÿáðÿ 1906 ãîäà, î âîçìîæíîñòè âûõîäà èç îáùèíû. Öåëü äàííîãî çàêîíà, êîòîðûé ïîäïèñàë ñìåðòíûé ïðèãîâîð èçâå÷íîé êðåñòüÿíñêîé îáùèíå - ïîâåðíóòü àãðàðíóþ ïðîáëåìó äðóãîé ñòîðîíîé, âìåñòî òîãî ÷òîáû ýêñïðîïðèèðîâàòü çåìëþ ó ïîìåùèêîâ, îáåççåìåëèâàëàñü îáùèíà, òàê êàê ïðèíàäëåæàâøèå îáùèíå çåìëè ðàñïðåäåëÿëèñü ìåæäó êðåñòüÿíàìè. Îäíàêî òðåáîâàëîñü ðàçðåøåíèå ïîñëåäíèõ íà ðàçðóøåíèå ýòîãî èíñòèòóòà, òîëüêî óêðåïèâøåãîñÿ â õîäå ðåâîëþöèîííûõ ñîáûòèé. Çà òî âðåìÿ ïîêà ñîñòàâëÿëèñü êðåñòüÿíñêèå çàïðîñû è ïðîõîäèëè çåìåëüíûå áóíòû - îáùèíà óòâåðäèëàñú êàê íàñòîÿùèé îðãàí êðåñòüÿíñêîãî ñàìîóïðàâëåíèÿ.[4]
Çåìåëüíûé âîïðîñ, îñòàâøèéñÿ íåðåøåííûì, ñ ñîáðàíèé I Äóìû, àâòîìàòè÷åñêè ïîÿâèëñÿ íà ñîáðàâøåìñÿ çàñåäàíèè II Äóìû 20 ôåâðàëÿ 1907 ãîäà. Íóæíî îòìåòèòü, ÷òî ïðåäâûáîðíàÿ êîìïàíèÿ ïðîøëà íå áåç âìåøàòåëüñòâà è äàâëåíèÿ íà èçáèðàòåëåé ñî ñòîðîíû âëàñòåé. Ñåíàòñêèå "ðàçúÿñíåíèÿ" èñêëþ÷èëè èç ÷èñëà èçáèðàòåëåé áîëüøèå ãðóïïû êðåñòüÿí è ðàáî÷èõ. Ïðåñëåäîâàëèñü ëåâûå âûáîðùèêè, çàïðåùàëèñü èçáèðàòåëüíûå ñîáðàíèÿ, ìàññà ìàíèïóëÿöèé áûëà ïðåäïðèíÿòà è ïóùåíà â õîä ïî ÷àñòè ðàññûëîê èçáèðàòåëüíûõ ïîâåñòîê, íàçíà÷åíèå äíÿ è ìåñòà âûáîðîâ. Íî íåñìîòðÿ íà ýòî, è õîòü âûáîðû ïðîõîäèëè â îáñòàíîâêå ñïàäà ðåâîëþöèîííîãî äâèæåíèÿ, II Äóìà îêàçàëàñü áîëåå ëåâîé, ÷åì ïåðâàÿ.