Большое внимание Троцкий уделял моральным стимулам. На многочисленных митингах отличившимся бойцам Троцкий раздавал серебряные портсигары. Был случай, когда подарков не хватило, нарком одному из красноармейцев вручил свои часы, а другому — свой браунинг. В конце августа 1918 г. он предложил учредить индивидуальный знак отличия. Это стало толчком к созданию первого советского ордена — ордена Красного Знамени. Кстати, моральные меры широко применялись и в борьбе с дезертирством; в результате почти половина сбежавших добровольно вернулись в Красную Армию. Но в поисках моральных стимулов мысль Троцкого иногда рождала предложения, унижавшие человеческое достоинство. Например, он предлагал введение для провинившихся черных воротников, которые снимались бы при безупречном поведении или проявлении воинской доблести.
Крупнейшей заслугой Троцкого стало привлечение военных специалистов. В годы гражданской воины в Красной Армии служила почти треть офицерского корпуса, 82 процента командующих армиями и фронтами имели военное образование. Он подчеркивал, что «на одного изменника приходится сотня надежных, на одного перебежчика — два-три убитых». Эти годы, безусловно, стали временем наиболее дружной работы Ленина и Троцкого. На VIII съезде партии, в отсутствие Троцкого, который срочно выехал на Восточный фронт, Ленин, отвечая ораторам из «Военной оппозиции», говорил: «Если вы... можете Троцкому ставить обвинения в том, что он не проводит политику ЦК, — это сумасшедшее обвинение. Вы ни тени доводов не приведете». В июле 1919 г., желая поддержать Троцкого в условиях споров в партийном руководстве и даже попытки Троцкого подать в отставку, Ленин на чистом бланке написал следующий текст: «Товарищи! Зная строгий характер распоряжений Троцкого, я настолько убежден, в абсолютной степени убежден в правильности, целесообразности и необходимости для пользы дела даваемого тов. Троцким распоряжения, что поддерживаю это распоряжение всецело. В. Ульянов-Ленин». Наконец, 17 октября 1919 г., когда Троцкий находился в Петрограде, отбивавшем атаки Юденича, Ленин в письме к нему, прилагая воззвание, заметил: «Спешил — вышло плохо. Лучше поставьте мою подпись под Вашим». По словам Горького, Ленин однажды сказал: «А вот указали бы другого человека, который способен почти в год организовать почти образцовую армию, да еще завоевать уважение военных специалистов».
Это впоследствии признавали и противники. Лидер эсеров В. М. Чернов писал: «Большевики доказали, что самая суровая, даже самая беспощадная дисциплина в революционной армии возможна, что возможно в ней и безусловное единоначалие... В... армии большевиков было преодолено то, с чем существование армии совершенно несовместимо: разъедающий ее дуализм и стихийная реакция на него в виде революционного самоуправства».
Но в эти же годы обостряются отношения Троцкого и Сталина. Вынужденный в военном отношении подчиняться Троцкому как член Реввоенсовета ряда фронтов, но равный ему в партийных и государственных должностях (оба с марта 1919 г. были членами Политбюро ЦК, с 26 октября 1917 г. — наркомами) Сталин с его самолюбием пытался вмешиваться в военные решения. Не менее самолюбивый и стремившийся приучить подчиненных к беспрекословному исполнению приказов, Лев Давидович не склонен был терпеть подобные вещи. В роли арбитра уже в 1918 г. приходилось выступать Ленину. Он стремился наладить их нормальную совместную работу.
Заканчивая сюжет «Троцкий и гражданская война», нельзя не затронуть проблем: «Троцкий и расстрел царской семьи», «Троцкий и расказачивание». Троцкий не имел непосредственного отношения ни к первому (его не было в Москве), ни ко второму (директива Оргбюро ЦК, принятая 24 января и отмененная на Пленуме ЦК 16 марта 1919 г., о поголовном истреблении верхов казачества) решению. Но, безусловно, Троцкий одобрял расстрел царской семьи, видя его смысл прежде всего в том, чтобы в условиях марта 1918 г. показать, что пути назад нет. Отношение к казачеству он выразил в тезисах «Руководящие начала ближайшей политики на Дону». Здесь, в частности, говорилось: «Наша политика не есть политика мести за прошлое... Мы строжайше следим за тем, чтобы продвигающаяся вперед Красная Армия не производила грабежей, насилий и проч... В то же время мы требуем от населения всего, что необходимо Красной Армии...».
27 ноября 1919 г. Троцкий и Сталин были награждены орденом Красного Знамени. Весной 1920 г. Троцкий был назначен наркомом железнодорожного транспорта. Он пытался приказом № 1042 ввести жесткий график ремонта паровозов. Жесткие административные меры первоначально дали определенный эффект. Но вскоре Троцкого освободили от этих обязанностей в связи с советско-польской войной. В 1920 г. он делает все, что было в его силах, для укрепления сложившейся военно-бюрократической системы, хотя и испытывает некоторые сомнения. Между тем «военный коммунизм» шел к своему закату.
В конце 1920—начале 1921 г. в партии вспыхнула так называемая дискуссия о профсоюзах. В ходе ее образовалось несколько платформ. При этом Троцкий и Ленин заняли различные позиции. Споры между ними были довольно шумными. Ленин говорил о «гигантских ошибках» и «вопиющих неправильностях» Троцкого, а тот упрекал Ленина в путанице, но оба подчеркивали свое уважение друг к другу". Все эти разногласия были сняты Кронштадтским мятежом и переходом к новой экономической политике. За подавление выступления кронштадтцев Троцкий был награжден вторым орденом Красного Знамени. Он поддержал и идеи НЭПа. Это было для него тем легче, что в феврале 1920 г. он внес в Политбюро предложения в связи с неэффективностью «продовольственной политики, построенной на извлечении излишков». Троцкий предлагал, в частности, заменить «изъятие излишков известным процентным отчислением... с таким расчетом, чтобы более крупная запашка или лучшая обработка представляли выгоду». Тогда против этого возражало большинство во главе с Лениным.
В 1921 —1922 гг. Троцкий и Ленин работают в тесном единстве. Идет резкое сокращение армии (к 1924 г. почти в 10 раз), флота. На первое место выдвигается задача учебы, освоения накопленного опыта. Центральное место в жизни страны занимают экономические проблемы. И хотя надежды на европейскую революцию, особенно в Германии, сохранялись, как и опасения новой войны, в целом шел процесс постепенной нормализации внутреннего и международного положения. Троцкий участвовал в теоретической разработке встающих перед страной вопросов. По его воспоминаниям, они с Лениным внимательно обсудили тезисы доклада о НЭПе на IV конгрессе Коминтерна. Речь шла прежде всего об использовании капиталистических методов и форм для социалистического строительства. Осенью 1922 г. в беседе наедине последовало предложение Ленина Троцкому стать его заместителем по Совнаркому.
Идя на уступки в экономике, советское руководство между тем никоим образом не собиралось отказаться от монополии коммунистической партии на власть. С этой же целью началось привлечение им на свою сторону интеллигенции, необходимой для развития экономики (амнистия, создание условий для творческой работы, рост зарплаты по сравнению с зарплатой рабочих и т. п.); одновременно решительно преследовались те, кто мог представлять потенциальную политическую опасность (репрессии по отношению к служителям различных религиозных конфессий, активным деятелям партий меньшевиков и эсеров, высылка в 1922 г. за границу или в провинцию деятелей российской интеллигенции,. особенно гуманитарной, и т. п.). Во всех этих случаях Троцкий и Ленин занимали общую позицию.
В это время Троцкий, безусловно, оценивался как «второй человек» в руководстве после Ленина. Сам он достаточно благосклонно воспринимал стремление части печати и окружающих сформировать культ его личности. В 1922 г. в параграфе 41 Политического устава Красной Армии была помещена его биография. Параграф заканчивался словами: «Тов. Троцкий — вождь и организатор Красной Армии. Стоя во главе Красной Армии, тов. Троцкий ведет ее к победе над всеми врагами Советской республики». Одним из первых переименованных населенных пунктов стала Гатчина, получившая название «Троцк».
Впервые за несколько лет появилось и время для отдыха. Троцкий увлекался охотой, рыбной ловлей, но ему все чаще и больше докучали болезни: радикулит, простуды, обострение хронического (с детства) катара желудка. Между тем приближался новый этап политической биографии Л.Троцкого.
В конце мая 1922 г. Ленин перенес первый инсульт. Он вернулся к работе лишь в октябре, но 12 декабря стало последним официальным днем его работы. Затем, с 23 декабря по 6 марта 1923 г., наполовину парализованный, он диктовал свои письма и статьи. После нового приступа, повлекшего потерю речи, Ленин до конца жизни стал политическим мертвецом. В этих условиях идет раскол внутри Политбюро и ЦК. Хотя личный момент играл здесь весьма значительную роль, на наш взгляд, неверно было бы сводить все только к нему или даже считать его определяющим. Главную роль играло различие во взглядах на будущие пути развития страны, судьбы европейской революции, стремление партийно-советского аппарата закрепить свое ведущее положение.